AI导读:

诺贝尔奖得主大卫·贝克团队在《科学》期刊上发表研究论文,首次利用AI技术从零开始设计了具有复杂活性位点的丝氨酸水解酶,标志着酶工程领域的重要里程碑。这一创新技术为设计高效酶开辟新道路,对国际经济产生深远影响。

在新一期《科学》期刊上,诺贝尔奖得主、美国华盛顿大学的大卫·贝克及其团队发表了一篇突破性研究论文。他们首次利用人工智能(AI)技术,从零开始设计了具有复杂活性位点的丝氨酸水解酶。这项成就标志着酶工程领域的一个重要里程碑,表明现在人们有能力设计出具有天然酶活性的酶,并且这些人工设计的酶还具备实际应用潜力,对国际经济产生深远影响。

传统酶设计方法面临巨大挑战,主要是因为受到结构灵活性和活性位点预组织程度的限制,从而影响催化效率。尽管化学手段可以在一定程度上克服这些问题,但最初计算设计的酶效率仍远低于天然酶。而AI技术的引入,为从头设计蛋白质提供了可能。

贝克团队此次引入了一种名为PLACER的新型机器学习网络,该网络通过分析蛋白质骨架、氨基酸特性和结合分子的化学结构,来预测酶活性位点的精确原子排列。这一创新技术为设计高效酶开辟了新的道路。

团队采用RFdiffusion技术创建含有复杂催化位点的蛋白质,并使用PLACER评估这些蛋白质的活性位点组织情况。最终,他们成功设计出了功能性丝氨酸水解酶,这些酶仅需最小化的活性位点规范就能有效地催化酯水解反应。此外,该方法还发现了5种全新的酶折叠方式,极大地扩展了酶家族的结构多样性。

这项研究不仅代表了从头设计酶的重大进步,也为开发更高效的催化剂开辟了新途径,对国际经济中的生物科技领域具有重要影响,同时有助于理解和扩展酶的功能性。

(文章来源:科技日报)